انبثقت مؤسسة شمل الأهلية من إيمانٍ عميق بأهمية توفير بيئة إنسانية آمنة لأطفال الأسر المنفصلة، وحمايتهم من الآثار السلبية لإنفصال والديه ومنع تعرض الطفل لبيئة تؤثر عليه سلبآ أثناء رؤيته لأحد والديه، وحمايته من العنف الأسري وتقديم الإرشاد الأسري لوالديه للتعامل معه في ظل الإنفصال. ولدت الفكرة حين برزت الحاجة إلى جهة متخصصة تراعي الخصوصية الأسرية، وتحدّ من التوترات التي قد تصاحب رؤية الطفل لوالديه؛ لتتحول التجربة إلى عملية منظمة، داعمة، ومطمئنة.